2. Battle City (Bagian 1)
Saat Kaiba mendengar tiga kartu dewa legendaris, dia percaya dengan ketiga kartu itu didalam deck nya, dia dapat mengalahkan Yugi.
Untuk mendapatkan kartu dewa ini, Kaiba menyelenggarakan turnamen yang diadakan di kota Domino, dengan peraturan untuk tiap orang yang mengikuti turnamen harus mempertaruhkan satu kartu yang akan diberikan pada pemenang duel kalau mereka kalah.
Yugi mendengar ketiga kartu dewa itu dan bagaimana kartu ini terikat pada legenda Mesir kuno, legenda yang melibatkan Pharaoh tanpa nama.
Di waktu yang sama, Marik Ishtar, penjaga Makam Pharaoh dan pemilik Millenium Rod yang memiliki kekuatan untuk mencuci otak, menginginkan kekuatan Pharaoh itu sendiri.
Pada versi Jepangnya, dia benar-benar berharap agar menyiksa dan membunuh Yugi untuk balas dendam dan untuk membebaskan keluarganya dari melayani Pharaoh tanpa nama.
3. Virtual World
Saat Yugi, Kaiba, Joey, dan Yami Marik melakukan perjalanan menuju ke tempat akhir Battle City, pesawat mereka tiba-tiba berubah arah.
Karakter utama pun terjebak di dalam simulasi dunia virtual, yang mana merupakan rencana dari mantan eksekutif KaibaCorp untuk balas dendam pada Yugi, Joey, dan Kaiba.
4. Battle City (Bagian 2)
Setelah keempat finalis dapat melarikan diri dengan selamat dari dunia virtual, mereka tiba di Pulau KaibaCorp.
Disana, mereka melakukan ronde terakhir Battle City, dan menghentikan Yami Marik dengan “Shadow Game” nya.
Duel seru dengan ketiga kartu dewa yang sudah pasti tidak beloh dilewatkan.