Kematian Rin telah terjadi sejak lama yang mana membuat banyak hal buruk menimpa dunia Naruto karena hal tersebut.
Seperti yang kita tahu, Kakashi-lah yang telah membunuh Rin pada saat itu, dan satu hal ini telah menghantuinya selama bertahun-tahun.
Pada saat itu, dia diculik dan menjadi Jinchuriki biju ekor 3 (Sanbi/Isobu) dan musuh Konoha berencana untuk mengeluarkan biju ini dari Rin ketika dia telah sampai disana.
Mengetahui hal tersebut, Rin dengan sengaja melompat ke arah serangan Kakashi untuk menghentikan rencana mereka.
Efek dari Kematian Rin
Ada satu hal yang tidak diketahui oleh Kakashi, Rin, atau bahkan Minato, yaitu kematian Rin yang dilihat oleh Obito.
Dengan melihat orang yang sangat dicintainya mati di tangan rekannya sendiri yang berjanji akan melindungi Rin, membuat Obito dengan mudah langsung menuju ke Madara untuk melakukan rencana mereka.
Kematiannya membangkitkan Mangekyo Sharingan milik Obito dan Kakashi, yang mana meningkatkan kekuatan mereka secara signifikan.
Obito yang bergabung dengan rencana ini kemudian menghasut Nagato untuk membentuk Akatsuki yang sesuai dengan tujuannya, yaitu mengumpulkan para biju untuk menyerap kekuatan mereka dan membangkitkan Juubi.
Hal ini juga membuat rencana Madara berjalan sesuai dengan keinginannya, yaitu agar dia dapat bangkit kembali dengan menggunakan kekuatan Rinnegan untuk melakukan Mugen Tsukuyomi.