Shisui khawatir Danzo mungkin juga akan mengambil matanya yang lain.
Karena itulah, dia mempercayakan mata itu kepada Itachi.
Shisui tahu apa yang akan terjadi jika matanya jatuh ke tangan yang salah.
Setelah kejadian itu, Itachi menanamkan mata Shisui pada seekor burung gagak untuk melindunginya.
Singkat cerita, di Chapter 403, Itachi mengirim tiruannya untuk melakukan percakapan dengan Naruto.
Setelah berbicara dengannya, Itachi menyadari bahwa Naruto akan menjadi satu-satunya orang yang tidak akan membunuh Sasuke jika Sasuke memutuskan untuk menyerang desa.
Lalu, Itachi memberikan burung gagak yang sebelumnya telah diberi mata Shisui.
Itachi kemudian menjelaskan arti penting gagak itu kepada Naruto.
Dia mengatakan bahwa telah memprogram mata pada gagak mengeluarkan Kotoamatsukami pada orang yang mengambil Mangekyou Sharingan Itachi.
Kotoamatsukami akan mengeluarkan genjutsu pada orang tersebut untuk memastikan bahwa mereka akan menyelamatkan Konohagakure.
Dia curiga bahwa adik laki-lakinya akan menjadi orang yang mengambil matanya.
Jika Sasuke berhasil melakukan itu dan memutuskan untuk menyerang Konohagakure, dia akan menghadapi Naruto.