Sementara itu, Aliansi Shinobi harus menghadapi dua musuh utama, yaitu Uchiha Madara yang muncul kembali.
Serta Zetsu putih berjumlah kurang lebih 200.000 yang telah bangkit untuk menyerang anggota Aliansi Shinobi.
Zetsu putih berani mengambil inisiasi serangan karena dia tahu bahwa para ninja tidak memiliki Jinchuriki untuk membantunya.
Setidaknya, begitulah seharusnya.
Perjalanan Naruto ke Pulau Penyu dijelaskan sebagai misi S-Rank rahasia yang hanya bisa diselesaikan olehnya.
Untuk sementara waktu, dia puas dengan tugas mencatat semua satwa liar yang ada di pulau itu.
Namun, dia mulai curiga ketika tidak ada ninja Konoha yang mengawalnya padahal saat itu anggota Akatsuki sedang mengincarnya.
Hilangnya Kapten Yamato adalah hal terakhir yang membuat kecurigaannya memuncak.
Kemudian, Jinchuriki yang penuh semangat itu mencoba untuk keluar dari pulau tersebut dengan cara kekerasan
Tetapi, usahanya itu dihalangi oleh guru pertamanya, Iruka-sensei.
Kemampuan sensorik Mode Sage langsung memberi Naruto semua informasi tentang perang yang perlu dia ketahui.
Tentu saja, setelah mengetahui semua hal itu dia marah karena disembunyikan di sebuah pulau sementara teman-temannya berjuang untuknya.
Dan tidak ada kata Iruka yang bisa meyakinkan dia untuk mengabaikan perjuangan mereka.