Ada sebuah teori yang mengatakan bahwa Bonney merupakan hasil eksperimen Vegapunk.
Di beberapa Chapter lalu, kita melihat Jewerly Bonney mengakui bahwa Kuma adalah ayahnya.
Hal tersebut membuat Luffy dan yang lain terkejut.
Bonney kemudian meminta Luffy, Jinbe, dan Chopper untuk tidak menyakiti Pacifista yang mirip dengan Kuma.
Walaupun dia tahu Pacifista polisi itu bukan Kuma, dia tetap tidak ingin melukainya.
Namun, dari sanalah muncul teori di antara para penggemar One Piece terkait dengan hubungan mereka berdua.
Teori tersebut mengatakan bahwa Bonney mungkin bukan putri kandung Kuma, tetapi anak hasil eksperimen Vegapunk.
Di antara penggemar One Piece lain, masih ada yang mempertanyakan, apa bukti teori tersebut.
Pada Chapter sebelumnya, ada beberapa bukti yang menguatkan teori tersebut.
Bukti pertama adalah tubuh dan wajah Jewelry Bonney dan Kuma sangatlah berbeda.
Ditambah lagi, Bonney pernah berkata di Chapter 1063 bahwa Kuma adalah satu-satunya orang tua yang dia miliki.
Bonney saat itu mungkin telah mengetahui bahwa Kuma bukanlah ayah kandungnya.
Namun, mengingat dialah yang telah merawat Bonney seperti putrinya sendiri, Bonney merasa bahwa Kuma adalah ayah kandungnya.
Itulah yang melatarbelakangi Bonney saat dia mengatakan Kuma adalah satu-satunya sosok keluarga yang dia miliki.
Bukti lain yang tidak kalah menariknya adalah pernyataan Bonney tentang Vegapunk dan Pulau Egghead.
Entah kita menyadarinya atau tidak, Bonney memiliki hubungan yang dekat dengan Vegapunk dan pulau tersebut.
Di beberapa Chapter yang lalu, kita melihat Bonney mengtakan bahwa dia tidak asing dengan Pulang Egghead.
Dia juga menambahkan sejak kecil Bonney sudah berada di pulau itu, saat Pulau Egghead belum semaju ini.
Selain itu, Vegapunk juga masih bekerja sendiri tanpa lima “Vegapunk” lain.
Itulah yang menyebabkan Bonney tahu arah tujuannya saat berada di Pulau Egghead.
Ditambah lagi, Bonney tahu betul bagaimana Vegapunk mengubah Kuma menjadi robot yang mengisyaratkan dia kenal ilmuan itu sejak lama.
Dan bukti terakhir adalah penelitian Vegapunk yang disebut Lineage Factor.
Penelitian tersebut yang nantinya akan membuahkan enam satelit atau klona dan Pacifista.
Itulah bukti yang menunjukkan bahwa Jewelry Bonney adalah hasil eksperimen Vegapunk di beberapa Chapter lalu.